チェックを入れると、メールサーバーからメールを受信しても、サーバー上のメールを削除しないで残しておきます。
ただし、いつまでもメールを残したままにしておくとメールボックスが満杯になって、新たなメールが受信できなくなる可能性があります。
この設定を有効にする場合は、適時手動受信するなどして削除する必要があります。
通常はチェックを入れる必要はありません。
これは、複数環境(他のメーラー、または他のコンピュータ)で同じメールアカウントのメールを受信するときに便利なオプションです。
また、サーバーに残さない場合はメールが受信済かどうかのチェックも行いません。